目前，市场上有成套的现代化畜禽粪便转有机肥设备，大致包括混料设备、前处理脱水设备、有机肥发酵设备、后处理烘干设备及造粒设备等，其中有机肥发酵设备为核心设备。用于畜禽粪便发酵的主流设备设施主要有3类: 条垛式发酵设备、发酵反应器式发酵设备（其中包括箱体内搅拌式发酵设备、发酵塔式发酵设备、卧滚筒式发酵设备、罐式发酵设备）以及纳米膜覆盖式发酵设施等。所用发酵工艺都为好氧发酵工艺，具体如下。

一、条垛式发酵设备

条垛式发酵设备结构较简单，按作用用途划分结构，分为行走部和翻垛部2 部分。做功原理上，利用条垛机的行走部，在堆垛槽内根据时间循环要求、需氧要求和温控要求，在工作区域内运动，利用翻垛部在行走过程中翻整堆槽内的畜禽粪便、秸秆和微生物菌的混合物，起到物料混合、促进氧气自然进入、水分自然蒸发及翻堆控温度等作用。

条垛式发酵设备结构简单，执行工作量也较简单，即行走，翻堆; 经设备工作运行，畜禽粪便与其它物料混合均匀，氧气进入较充分; 设备一次性处理量较大，而且设备承载能力强，性能稳定; 由于畜禽粪便发酵需要一定热源提供，以促进快速发酵，减少污染可能性，而条垛式发酵设备自身无加热功能，仅依靠自然环境温度提供一定热量，因此一次物料发酵时较长; 设备占地规模大，且需要有相应的配套防漏雨设施; 投入成本高，运行成本 (用能) 低; 属于半密闭空间处理，有一定环境污染性; 产出有机肥产品品质较差; 除水效果一般; 适宜处理中大型养殖场产粪便量; 设备应用过程中，腐蚀较严重，易损坏; 南方地区应用较适宜，东北地区由于环境温度原因，应用较不适宜。

二、发酵反应器式发酵设备

通过设备工作可使畜禽粪便和其它混合物料完全发酵; 设备自身具备混合物料功能，无需外加混料装备; 投入成本较低，运行成本 (用能) 较低; 设备处理规模较大，适宜各种大中小型养殖场应用; 设备承载能力强; 设备属于全密闭空间处理，并且产生的各种污染会进行二次处理，不会对环境造成二次污染; 设备占地规模小; 设备具有给物料加热功能，同时氧气进入仓内较充分，混料均匀性好，因此提供发酵条件很好;因能使畜禽粪便与其他混合物料完全发酵所以产出的有机肥可直接下地，有机肥品质高、除水效果好;设备应用过程中，没有腐蚀;设备适合我国大部地区。

三、分子覆膜盖发酵设施

分子膜覆盖发酵设施结构上由分子膜和堆放场地组成 (堆放场地需建防渗漏层，并且内装有通风管道和流水管道)。分子膜覆盖发酵设施发酵做功形式简单，仅需要利用分子膜对混合发酵物料堆覆盖，利用堆放场地内的通风管道通氧气，利用堆放场地内的流水管道排水，完成堆肥发酵，其中分子膜为核心技术，具有便于水分气化蒸发和防止臭气排出功能。